潜心学术、勇攀高峰

我校2023年北京市优秀博士学位论文获得者风采展（三）|肿瘤医院-刘天媛

博士学位论文是博士生创新成果的集中呈现，反映了高水平人才对于世界科技发展前沿和人类文明进步的重要关切。评选优秀博士学位论文，旨在加强高层次人才创新能力的培养，提高博士生教育的质量，激励博士生开展原创性的研究工作。希望以此为契机，鼓励各位同学刻苦钻研学术，勇攀科学高峰。在北京市教育委员会、北京市学位委员会组织的2023年北京市优秀博士学位论文（以下简称“优博”）评选中，北京市共评出优秀博士学位论文104篇，优秀博士学位论文提名31篇，我校5篇论文获评北京市优秀博士学位论文，3篇论文获评北京市优秀博士学位论文提名。

今天，让我们一同走进刘天媛博士的学术世界。

刘天媛博士（左一）与导师吴晨教授（右一）

个人简介

刘天媛，中国医学科学院肿瘤医院，肿瘤学（基础）专业 2022届博士毕业生，师从吴晨教授，博士课题为食管癌变多阶段过程中上皮细胞调控分化活性与细胞癌变进展风险的相关性分析，相关研究以一作以及共一发表在Cancer Cell, Cancer Research, Nature communications等医学顶级期刊上。在校期间，曾获研究生一等奖学金（2021年）、研究生二等奖学金（2022年）、 2022年优秀毕业生等荣誉称号。

主要研究经历为:

1. 探究癌变过程中组织特异性转录因子失活与癌变风险增加的相关性

---本项目开发了基于单细胞转录组和空间转录组学数据的分析框架CancerStemID，构建了组织特异性转录因子调控细胞分化活性评估指标TFIL。根据分化轨迹与拟时序分析，计算了肿瘤癌变风险与转录因子失活的相关性。

2. 基于4NQO诱导小鼠食管癌变模型解析癌变微环境特征

---本项目基于化学致癌剂4NQO诱发模拟人类食管癌发生的多阶段小鼠模型，通过单细胞转录组技术，探究从炎症到浸润癌多阶段上皮细胞与微环境细胞的动态演变。研究揭示了上皮细胞癌变偏离了正常分化轨迹，其转录组显示通路激活的时序差异。

论文内容及创新点

研究以食管癌多阶段的癌变过程作为重点研究对象，以上皮细胞的演变作为切入点，关注癌变过程中组织特异性转录因子的改变。评估食管特异性转录因子演化过程中的活性改变，并揭示了食管特异性转录因子在癌变过程中普遍失活的全局性改变特征。通过比较食管特异性转录因子在正常和癌组织中的基因组变异（点突变及拷贝数变异）以及启动子区域甲基化水平，我们发现这些转录因子的启动子区域发生了的甲基化水平显著升高，而基因组变异事件则频率更低，提示启动子甲基化水平可能导致了组织特异性转录因子的失活。

本研究探究了肿瘤发生过程中关键的组织、细胞和分子事件，聚焦组织特异性转录因子失活过程的影响及相关机制。相关研究将加深我们对肿瘤发生发展过程的理解，为预测癌变进展风险提供新思路，并助力食管癌早诊早治细胞与分子靶点的开发。

代表性创新成果

1. Y Chen*, S Zhu*, T Liu *, S Zhang*, J Lu*, W Fan*, L Lin*, Yang J, Zhao X, Xi Y, Ma Y, Cheng G, Lin D, Wu C. Epithelial cells activate fibroblasts to promote esophageal cancer development. Cancer Cell (2023). doi: 10.1016/j.ccell.2023.03.001IF: IF=50.3 Q1 .

2. T Liu, Y Lin, C Wu. Resolving mutational signatures in cancer development. Cancer Cell (2023). doi: 10.1016/j.ccell.2022.05.011IF: IF=50.3 Q1.

3. J Chang*, X Zhao*, Y Wang*, T Liu*, C Zhong, Y Lao, S Zhang, H Liao, F Bai, D Lin, C Wu. Genomic alterations driving precancerous to cancerous lesions in esophageal cancer development. Cancer Cell (2023) doi: 10.1016/j.ccell.2023.11.003IF: IF=50.3 Q1.

4. T Liu*, X Zhao* , Y Lin*, Q Luo*, S Zhang *, Y Xi, Y Chen, L Lin, W Fan, J Yang, Y Ma, A Maity, Y Huang, J Wang, J Chang, D Lin, A Teschendorff & C Wu. Computational identification of preneoplastic cells displaying high stemness and risk of cancer progression. Cancer Research (2022). doi: 10.1158/0008-5472.CAN-22-0668IF: IF=11.2 Q1.

5. J Yao*, Q Cui*, W Fan*, Y Ma*, Y Chen*, T Liu*, X Zhang, Y Xi, C Wang, L Peng, Y Luo, A Lin, W Guo, L Lin, Y Lin, W Tan, D Lin, C Wu & J Wang. Single-cell transcriptomic analysis in a mouse model deciphers cell transition states in the multistep development of esophageal cancer. Nat Commun 11, 3715 (2020). doi:10.1038/s41467-020-17492-yIF: IF=16.6 Q1.

经验分享

1. 面临挑战，寻找自己的锚点。

博士生活并非一帆风顺，我面对过许多挑战，其中最大的挑战之一是在研究旅途中保持坚持和动力。在这个过程中，我的导师和同事们成为了我的支柱，共同克服困难。我逐渐认识到平衡是成功的关键。平衡学术研究、社交活动和个人兴趣是至关重要的。充分利用学术资源的同时，保持身心健康，这对于度过研究中的低谷至关重要。

2. 把艰难的挑战分解成可操作的mini任务。

定下冒险目标：先搞清楚你要冒险干啥，设定个酷炫的研究目标。文献大冒险：文献像是领域的地图，要多翻翻，找到藏宝图，别让论文变成沉闷的冒险剧情。实验冒险者工具：描述实验和方法时，别含糊，要有点冒险者风范。数据解谜冒险：用靠谱的数据解谜工具，别让数据变成冒险丛林。讨论冒险篇：和文献结伙冒险，分析研究结果的坏处和接下来怎么冒险。

博士求学之路是充满曲折和挑战的冒险旅程，但也是充满成就和收获的过程。在未来的冒险之路上，愿我们的剑永远锋利，魔法永远生效，成为学术冒险领域里的传奇冒险者。加油冒险！

图片、文字：均由刘天媛博士提供。

编辑：研究生培养处。